Mikroorganismu ekoloģijas principos balstīta sarežģītu mikrobiālo sabiedrību kultivācijas sistēmas izstrādne

1.1.1.3. Praktiskas ievirzes pētījumi, 1. kārta

Projekta nosaukums: “Mikroorganismu ekoloģijas principos balstīta sarežģītu mikrobiālo sabiedrību kultivācijas sistēmas izstrādne.”
Projekta līguma numurs: Nr. 1.1.1.3/1/24/A/104
Projekta īstenošanas termiņš: 01.09.2025. - 31.08.2028. (36 mēneši)
Projekta kopējais finansējums: 656 000.00 EUR (ERAF 509 712.00 EUR; Valsts budžeta finansējums 89 872.00 EUR; Privātās attiecināmās izmaksas 33 849.60 EUR)
Projekta vadītājs / vadošais pētnieks: LU Medicīnas un dzīvības zinātņu fakultātes asoc. prof. Dr.biol. Jānis Liepiņš

Projekta administratīvais vadītājs: Laureta Buševica, e-pasts: laureta.busevica@lu.lv

Projekts ir saistīts ar jauna tipa tehnoloģijas un bioreaktora prototipu izveidi, kas piemērota dažādu mikroorganismu sabiedrību kultivēšanā (NACE 2 kodi: 72.10).

Projekts tiks īstenots sadarbībā ar diviem partneriem: SIA “BIOSAN”, laboratorijas iekārtu ražotājs; SIA “Metabonet”, uzņēmums specializējas metabolomikas paraugu analīzē.

Projekta mērķi ir: 

Izstrādāt tehnisko risinājumu (tehnoloģiju un bioreaktora prototipu), kas ļautu pielietot mikrobu ekoloģijas principus ierobežota apjoma kompleksu mikrobu kopienu kultivēšanai, monitoringam un bagātināšanai bioreaktoru sistēmā. .

Projekta rezultāti sekmēs sekojošas Latvijas Pētniecības un inovācijas viedās specializācijas stratēģijas (RIS3) prioritātes:

1. Biomedicīna, medicīnas tehnoloģijas, farmācija, biotehnoloģija; 
2. Fotonika un viedie materiāli, tehnoloģijas un inženiertehniskās sistēmas.

Projekta rezultāti:

1. Trīs atvērtās piekļuves Q1 zinātniskās publikācijas.
2. Divas lielo datu kopas , kas glabājas publiskajos datu repozitorijos, nodrošinot datu ilgtspēju un ievērojot FAIR principus.
3. Bioreaktora prototips , kas apvieno vairākus paralēlus kultivācijas tilpumus, nelielu darba tilpumu ar funkcijām, kas ļauj kontrolēti pārvietot masu starp kultivēšanas tilpumiem.
4. Zinātība (know-how) kā ieviest mikroorganismu ekoloģijā balstītus principus maza mēroga bioreaktoru projektēšanā.
5. Agrīnās karjeras pētnieka nodarbināšana – 1 jauna pētnieka amata vieta.

Plānotās projekta darbības:

1. Inovatīva uz mikrobu ekoloģiju balstīta tehnoloģija ierobežota apjoma sarežģītu mikrobu kopienu kultivēšanai un uzraudzībai.
2. Maza mēroga, vairāku tilpumu bioreaktora prototips, kas pielāgots sarežģītu mikrobu kopienu uzturēšanai.
3. Inovatīvās tehnoloģijas un bioreaktora prototipa validācija.
4. Projekta koordinācija, atbalsts, rezultātu izplatīšana un publiskā komunikācija.

Rezultāti:

· Trīs atvērtās piekļuves Q1 zinātniskās publikācijas.
· Divas lielo datu kopas , kas glabājas publiskajos datu repozitorijos, nodrošinot datu ilgtspēju un ievērojot FAIR principus.
· Bioreaktora prototips , kas apvieno vairākus paralēlus kultivācijas tilpumus, nelielu darba tilpumu ar funkcijām, kas ļauj kontrolēti pārvietot masu starp kultivēšanas tilpumiem.
· Zinātība (know-how) kā ieviest mikroorganismu ekoloģijā balstītus principus maza mēroga bioreaktoru projektēšanā.
· Agrīnās karjeras pētnieka nodarbināšana – 1 jauna pētnieka amata vieta.

   

Izveidota bioreaktora prototipa strukturālā shēma, sastādīts komponenšu saraksts un identificēti ražotāji un iespējamie piegādātāji.

Uzsākts darbs ar sintētiskām mikroorganismu (raugu) sabiedrībām. Veikti eksperimenti arī ar sintētiskām sabiedrībām, kas satur trīs raugu celmus, nosakot kokultivācijas partneru šūnu skaita proporciju  ietekmi uz  daudzveidību sabiedrībā.

Baktēriju un sēņu paraugiem pārbaudītas dažādas ekstrakcijas metodes, lai noteiktu optimālo metodi tālākām metabolomikas analīzēm.